Предположим, у вас есть строка tr с несколькими флажками, и вы хотите считать только в том случае, если установлен первый флажок.
Это можно сделать, присвоив класс первому флажку
Например, class='mycxk'
, и вы можете посчитать это, используя фильтр, например:
$('.mycxk').filter(':checked').length