RavenDB не будет работать, если вы укажете 2 встроенных экземпляра в папке сохранения данных (на диске). Вы получите ошибки, потому что он ожидает, что только один экземпляр будет иметь доступ к файлам одновременно.
Однако у вас может быть 2 отдельных экземпляра, каждый со своей папкой на диске, а затем реплицироваться между двумя из них.