Функция pthread_cond_init() не будет работать, если:
EAGAIN Системе не хватало необходимых ресурсов (кроме памяти) для инициализации другой переменной условия.
Со справочной страницы pthread_cond_init().
Какими могут быть другие ресурсы, о которых говорится в цитате?