Git представляет все как набор объектов, либо на диске (как незакрепленный объект), либо в виде пакета (как сжатый объект). При клонировании git просматривает всю историю, чтобы определить, какие объекты отправлять. Если объект отсутствует, то это плохая новость - сообщение об ошибке верное, хранилище, скорее всего, повреждено (пропал потерянный объект или, возможно, весь пакет).
Вы МОЖЕТЕ иметь шанс, пытаясь клонировать другую ветвь. Если ходок не наткнется на этот пропавший объект, все будет в порядке. Если вы чувствуете себя безумно честолюбивым, вы можете заглянуть в структуры данных git storage и посмотреть, сможете ли вы собрать историю вручную (это будет невероятно сложно, но не невозможно).
В противном случае - это мерзавец. Если вы недавно сделали клоны, то поздравляю, у вас есть полная резервная копия. Нажмите от вашего клонированного репо, и недостающие объекты будут заполнены.
Удачи.