FlowPlayer работает на стороне клиента. Другими словами, он загружается в веб-браузер после передачи HTML-кода страницы с сервера на клиент.
Это означает, что файл в любом случае должен быть загружен извне через сам браузер (поскольку FlowPlayer просто указывает на этот файл, давая браузеру знать, откуда его извлечь). Поэтому нет способа полностью скрыть файл.
Тем не менее, вы могли бы затруднить поиск. Тем не менее, я не думаю, что это когда-либо возможно с FlowPlayer. Вам пришлось программировать свои собственные методы, которые позволили бы осуществлять прямую потоковую передачу содержимого на стороне сервера.