Переместите (не копируйте) файл .tt в другую сборку, затем отредактируйте его и измените путь «inputfile» на относительный путь из каталога этой сборки в каталог edmx.
Чтобы обновить, щелкните правой кнопкой мыши, запустите пользовательский инструмент или откройте файл .tt и сохраните.