Лучшее, о чем я могу подумать, - это обслужить файл, который будет связан, чтобы открыть его в соответствующем приложении. Таким образом, если вы обслуживаете файл .doc, пользователь обычно открывает его в Word ... при условии, что Word установлен и настроен таким образом ... невозможно гарантировать это.
Но вы не можете взаимодействовать с приложением напрямую из браузера - как уже отмечали другие, это будет кошмар вредоносного ПО, если это возможно.