В соответствии с httpCompression Element вы можете найти файл конфигурации с этим элементом в:
Machine.config
ApplicationHost.config
Корневое приложение Web.config
Приложение Web.config
Directory Web.config
Итак, вы должны создать правильный файл web.config и переместить его в нужную директорию .
UPDATE
Если вы хотите сделать это сами, чтобы увидеть Предупреждение кодировки ASP.NET GZip - это хорошая статья. Я полагаю, вы должны написать HttpModule, который решит - нужно сжатие или нет.