MSSQL Standard Edition (32 или 64-разрядная версия) будет стоить около $ 5K за сокет процессора . 64 бит позволит вам использовать столько оперативной памяти, сколько вам нужно. Корпоративная версия на самом деле не нужна для большинства развертываний, поэтому не беспокойтесь о 20 тысячах долларов, которые понадобятся для этой лицензии.
MySQL бесплатен только в том случае, если вы отказываетесь от множества полезных инструментов, предлагаемых с лицензиями, и, вероятно, (по крайней мере, с 2008 года) будет немного больше работы по его масштабированию, подобному Sql Server.
В долгосрочной перспективе я думаю, что вы потратите гораздо больше на оборудование и людей, чем на лицензии. Если вам нужно масштабировать, то у вас, вероятно, будет денежный поток для обработки 5 тыс. Долларов тут и там.