Демонстрация очень сложна для работы, и вы добавили некоторые CSS в HTML как ссылки, а некоторые как управляемые ресурсы в jsFiddle, которые загружаются дважды, поэтому очень трудно создать рабочуюскрипка.В будущем я могу предложить вам включить соответствующие части, которые не работают.Построение Short, Self-Contained, Correct (Compilable), Example часто приводит к выяснению, где проблема также и у вас: -)
Тем не менее, удаляя из раздела CSS следующеев скрипте, и управляемые ресурсы, кажется, исправляют это для меня.
#header {
z-index:2; // <-- remove this
}
Проблема в том, что меню и контент имеют разные контексты стека - см. Перекрытие и z-index дляотличное описание этой концепции.