Как я могу быть уверен, что действующий пользователь не зайдет на мой сайт, войдет в систему и после этого использует Fiddler для извлечения токена?
Вы не можете.Но в этом весь смысл аутентификации пользователей и авторизации.Вы используете аутентификацию для идентификации вашего пользователя (после того как он предоставил имя пользователя и пароль) и даете ему токен (куки-файл аутентификации), который позже будет использоваться для доступа к вашему API.
Вы используете авторизацию для ограничения того, что пользователь может делать с этим токеном.Например, вы можете сказать, что только зарегистрированные пользователи, принадлежащие к группе администраторов, могут получить доступ к данному действию контроллера:
[Authorize(Roles = "Admin")]
public ActionResult SuperSecret()
{
...
}
Теперь, даже если пользователь вошел в систему и имеет токен аутентификации, он не будетможет получить доступ к этому действию контроллера, если он не принадлежит к группе администраторов.