LINQ to SQL для приложений, которые будут использовать только SQL, когда-либо.
Entity Framework предназначен для приложений, которым необходимо предоставить подключаемый источник данных (Oracle, MySQL, SQL, XML и т. Д.).
Моя философия в отношении слухов состоит в том, чтобы использовать то, что имеет смысл для данного проекта, который вы считаете стабильным, и беспокоиться о «поддержке», когда вы получаете официальные заявления от MS (или любой другой компании) положительно или отрицательно по этому поводу. На данный момент оба поддерживаются.