Ваша пара ключей SSH представляет вашу личность, определяемую либо адресом электронной почты (удобно), либо парой имя пользователя @ машина (неудобно). Вы должны генерировать новые ключи, если у вас есть новый корпоративный адрес электронной почты; технически (*), вы можете решить, связывать ли его с вашим профилем GitHub, который поддерживает несколько ключей на пользователя.
(*) Я не юрист, это не юридическая консультация, и я не уверен, разрешено ли вам иметь несколько учетных записей GitHub. Проверьте их условия использования.