Хммм. Может быть проблема с реализацией ...
Возможно, попробуйте
$("#name option").remove();
если вам нужно что-то узнать о том, что было удалено, то перед загрузкой загрузите их в переменную.
var $opts = $("#name option");
затем вы можете использовать индекс для добавления их обратно в:
$("#name").append( $opts.eq(n) );