В настоящее время нет доступных двоичных файлов для MonoDevelop для Windows. Это потому, что он не был проверен и очень глючит. То есть: вы, вероятно, не получите больше минуты или двух использования, прежде чем он выйдет из строя. Надеемся, что сейчас выйдет MD 2.0, и мы скоро сможем заняться этим.
Обратите внимание, что вам не нужен MonoDevelop для использования Mono. Вы можете использовать те же двоичные файлы, которые были созданы в Visual Studio или SharpDevelop для Mono.