Я создал пару приложений хорошего размера с использованием WPF и VS 2008. Дизайнер в порядке - я обнаружил, что в итоге я непосредственно редактировал XAML вручную. Таким образом, дизайнер стал скорее «предварительным просмотром» для того, что я набрал, а не инструментом, который я использовал для создания разметки.
Для любых нетривиальных вещей пользовательского интерфейса (анимация является ярким примером), я бы посоветовал вам взглянуть на Expression Blend. Как только вы преодолеете интерфейс «graphics designer-y», он предоставит намного более удобный способ задания анимации.
VS 2010 / .NET 4 предоставляет несколько приятных улучшений, но вы наверняка сможете выполнить то, что ищете в VS 2008.