с макушки головы;В контроллере вы можете использовать Request.Url.Authority для получения домена.Затем установите viewdata на путь вашей таблицы стилей в зависимости от домена.
Затем, по вашему мнению, сделайте что-то вроде этого;
<link href="<%= "" + ViewData[Namespace.StyleSheetKey] %>" rel="stylesheet" type="text/css" />