(извините, не проверено)
Вы хотите сделать что-то подобное для какого-либо события или действия в вашем коде:
panel_to_hide.hide({type: 'flip',duration: 5000});
, а затем
panel_to_show.show({type: 'flip',duration: 5000}); //may be you want to place this in hide event of the first panel.
Пожалуйста, дайте мне знать, если это работает.