Я успешно сделал это, хотя сначала у меня возникли некоторые проблемы с документацией, содержащей только пример php.
Просто убедитесь, что вы присоединяете queries
json как второй параметр ввызов API, а не в виде строки запроса, как в примере PHP.То есть:
FB.api('/fql', {q:{"query1":"SELECT uid, rsvp_status FROM event_member WHERE eid=12345678","query2":"SELECT name, url, pic FROM profile WHERE id IN (SELECT uid FROM #query1)"}},
function(response) {
// handle response
});