Полагаю, вы открываете соединение один раз и оставляете его открытым.В какой-то момент соединение либо прервалось, либо из-за некоторого сбоя в сети соединение было недействительным / закрыто.Лучший способ получить доступ к базе данных - это открыть соединение, когда вам нужно выполнить работу, а затем закрыть его.Или, в качестве альтернативы, измените код для поддержки повторного подключения при возникновении ошибки.
На основании обсуждения в комментариях ниже я бы предложил сбросить базу данных доступа в файл csv, а затем использовать что-то вроде PHPMySql дляимпортировать данные в MySQL.
Вы можете использовать инструмент BigDump для импорта больших дампов баз данных в MySQL.(через этот сайт )