Будет эффективнее заменить:
gdc => gdc.ToList()[0].groupID
на:
gdc => gdc.Key
Кроме этого, похоже, что я бы сделал.
Поочередно, если у вас все в порядке с методами расширения через LINQ (я лично предпочитаю их), его можно еще больше сократить с помощью:
var t = data.GroupBy(data => data.groupID).ToDictionary(gdc => gdc.Key, gdc => gdc.ToList());