Этот тест от db4o может быть полезен. Он включает в себя JavaDB (построенный поверх Derby), HSQLDB, SqlLite.
Кажется, HSQLDB превосходит своих аналогов, особенно когда речь идет о записи. H2, являясь преемником HSQLDB, работает быстрее, чем HSQLDB, как при чтении, так и при записи с функциями оптимизации, кластеризации и изоляции транзакций.