Примечание: Вам понадобится администратор для доступа к настраиваемым полям
my $soap = SOAP::Lite->proxy("http://jira_url/rpc/soap/jirasoapservice-v2?wsdl") or die $!;
my $login = $soap->login($user,$passwd)->result();
my $cfresult = $soap->getCustomFields($login);
my $cfarray = $cfresult->result;
my %cfhash;
foreach $cfld (@{$cfarray}) {
$cfhash{$cfld->{'name'}} = $cfld->{'id'};
}