Думайте об этом логически, и попробуйте немного упростить это;
Если вы хотите сделать это через WiFi, вам понадобится «что-то» на устройстве для сканирования и отправки, а такжечто-то на «сервере», например, веб-сервисе;так что вам действительно нужно написать две вещи.
Простой вариант - собрать простой веб-сервис ASP.Net для получения данных (и их обработки, аутентификации и т. д.).
После этого вы можете написать приложение для вашего устройства CE, которое взаимодействует с указанным веб-сервисом и обрабатывает взаимодействие с пользователем (большинство сканеров подделывают нажатия клавиш в элементе управления с фокусом).Имейте в виду, что вам также может понадобиться справиться с ситуациями, когда WiFi находится за пределами диапазона.
Если вы ориентируетесь на Windows CE, вы не можете сделать это в Visual Studio 2010 или более поздней версии (насколько яв курсе), поэтому вам, возможно, придется воспользоваться VS 2008 (чтобы максимально увеличить жизненный цикл поддержки)