Я не уверен, что вы подразумеваете под "обычным MySQL", но я обеспокоен тем, что вы можете иметь в виду запросы со строковыми конкатенациями.Таким образом, самое прямое преимущество использования такой инфраструктуры, как PDO, - это использование подготовленных и параметризованных запросов.Это снижает риск внедрения SQL (но не обязательно устраняет его, поэтому не думайте об этом) и в то же время, в зависимости от сервера базы данных, может позволить серверу улучшить кэширование планов выполнения запросов для повышения производительности.
На более высоком уровне идея использования такой инфраструктуры состоит в том, чтобы немного больше абстрагировать фактические компоненты доступа к данным от логики приложения, что всегда является достойной целью.По сути, вместо непосредственного взаимодействия с базой данных, вы будете взаимодействовать, в первую очередь, с инфраструктурой доступа к данным (которая в этом случае может по-прежнему поддерживать тесную связь с реализацией базы данных, так что имейте это в виду) и позволять ей обрабатывать доступ к базе данных,Одним из основных преимуществ этого подхода является то, что если вы меняете реализацию базы данных (например, переходите с MySQL на PostgreSQL), вам не нужно менять свой код.Вы просто используете реализацию PDO последнего как замену для первого.