SVN обнаруживает изменения файлов путем сравнения файлов. Afaik метки времени файла вообще не учитываются.
Мой самый безопасный шаг сейчас заключается в повторной проверке репо на сервере, что требует очень много времени и его желательно избегать.
Я не правильно понимаю, что вы пытались объяснить, действительно ли повреждено хранилище на сервере SVN или ваша рабочая копия повреждена? Если последнее верно, то вы действительно можете попытаться
a) «очистить», а затем «обновить» вашу рабочую копию или
b) сначала верните свою рабочую копию, затем обновите ее или
c) получить новую рабочую копию.
Если репозиторий SVN поврежден, вы должны как минимум сделать резервную копию своей рабочей копии как можно скорее на тот случай, если вы не сможете восстановить репозиторий SVN на сервере (в этом случае у вас по крайней мере будет последняя копия в вашем рабочем каталоге и может попытаться настроить новый репозиторий SVN и проверить содержимое этого рабочего каталога.