у вас может быть столбец отметки времени в таблице.все строки, которые обновляются, будут иметь текущую метку времени.и затем вы можете выполнить запрос на удаление, выбрав все строки, чьи метки времени будут меньше, чем приблизительное время при обновлении таблицы.хотя это не полностью корректное решение.
другое - установить значение некоторых столбцов при обновлении, а затем удалить строки, значение столбца которых не обновлено