Какой вид вы используете?По умолчанию Eclipse не будет показывать вам эти классы, например, в представлении Package Explorer, но будет отображать в представлении «Navigator».Таким образом, они действительно могут быть там, а вы их просто не видите.
В противном случае, просто попробуйте перестроить свой проект, используя опции, доступные в меню «Проект».