Увидел ту же проблему, но для меня это было потому, что подстановочный знак ISAPI использовал неправильный файл ISAPI.
эти версии существуют
64bit .net 2.0 aspnet_isapi.dll
32-разрядная .net 2.0 aspnet_isapi.dll
64-разрядная .net 4.0 aspnet_isapi.dll
32-разрядная .net 4.0 aspnet_isapi.dll
32-разрядная .net 4.0 aspnet_isapi.dll может бытьприменяется и все еще позволяет моему сайту работать.