Сценарий пытается сделать что-то вроде document.write ()?Это не будет работать при динамической загрузке, только при начальной загрузке страницы.
Как правило, скрипты, содержащиеся в HTML, который является innerHTML'd, не оцениваются согласованно во всех браузерах.Чтобы это исправить, jQuery фактически ищет теги сценария и выполняет их вручную.
Но это не имеет значения.Даже если jQuery этого не сделает, скрипт будет работать в другом типе контекста, чем обычно, когда страница загружается в первый раз.Это больше не «встроенный скрипт», и многие сторонние скрипты были написаны как «встроенные» в качестве предположения.Вам нужно выяснить, что делает скрипт, и найти способ вызвать его с помощью динамического контента.