Если навести курсор мыши на вопросительный знак, он должен показать детали. Я полагаю, что вопросительные знаки были введены в Flash Builder 4.5. Они являются своего рода «выделением проблем при вводе».
Часто эти вопросительные знаки при сохранении файла превращаются в желтые восклицания (AKA Warnings) или красные X (ошибки AKA).
Однако, если вы используете директиву include для включения одного файла ActionScript в другой, он может отображать эти вопросительные знаки в файле include, даже если на самом деле проблемы нет.