Нет, XHProf не записывает аргументы функции.
Я обнаружил, что обычно могу получить то, что мне нужно, отслеживая стек вызовов по функции, на которую я смотрю. Например, если это вызов MySQL, знание родителя обычно скажет вам, что вам нужно знать о том, откуда поступает запрос.
Если ничего другого, пусть XHProf покажет вам функцию, на которую вам нужно взглянуть поближе, и добавьте собственную регистрацию, чтобы выяснить, что это за аргументы.