Попробуйте (\epsilon, F_{\alpha_2}, \epsilon) \rightarrow (F, \alpha_1). Это должно работать.
LaTeX действительно жалуется на часть F_\alpha_2. Он не знает, хотите ли вы иметь F_{\alpha 2} (т. Е. alpha и 2 на одном уровне) или F_{\alpha_2} (\alpha и подписку 2 в нижнем индексе).
Если вы не окружите подстрочный фрагмент { и }, LaTeX примет только следующий знак в качестве подстрочного индекса. Но так как вам нужно два знака в нижнем индексе (\alpha и 2), вы должны как-то заключить его в скобки.