Вы имеете в виду пустой как в нуле?
scala> val map = collection.immutable.HashMap[Int, String] (1 -> "a", 2-> "b", 3 -> null)
map: scala.collection.immutable.HashMap[Int,String] = Map(1 -> a, 2 -> b, 3 -> null)
scala> val newmap=map filter (_._2 != null)
newmap: scala.collection.immutable.HashMap[Int,String] = Map(1 -> a, 2 -> b)
РЕДАКТИРОВАТЬ: черт побери ... @missingfaktor избил меня до этого ...:)