Похоже, вы просто добавляете новый div в конце текущего абзаца. Вместо этого я думаю, что вы хотите пройти DOM и найти li, который является его родителем, а затем вставить / добавить ниже.
Использование jQuery
$('.comment-reply-link').click(function() {
var parent = $(this).closest('li'); // Find the nearest li (parent)
parent.append(addComment.moveForm("comment-reply-25", "25", "respond", "383"));
Что-то в этом роде.