Уверен, что особых соображений нет.Cpanal не будет использоваться для управления сфинксом, но он будет работать просто отлично.Возможно, вам придется проверить брандмауэр, чтобы убедиться, что приложения могут связаться с портом сфинкса.
(мне не нужно было устанавливать sphinx на сервере cpanel, но я немного использовал cpanel. Использовал sphinx с plesk - и там тоже ничего особенного не требовалось)