Я нашел решение для этого, и это так же просто, как указать параметр --prefix для настройки.
Для qmake в командной строке вы просто добавляете параметр PREFIX =:
qmake PREFIX=/usr/local
Есть два способа сделать это в QtCreator. Во-первых, вы можете изменить ваш .pro-файл, включив в него явное определение переменной PREFIX. Однако это не рекомендуется, так как префикс является предпочтением, специфичным для каждого пользователя, и предпочтительно, чтобы распространяемые файлы проекта были общими. Лучший способ сделать это - в ваших собственных настройках проекта. Просто перейдите к используемой конфигурации сборки, раскройте настройки qmake и добавьте PREFIX = к дополнительным аргументам.