Задержка родительского узла на MPI_Barrier - PullRequest
0 голосов
/ 02 августа 2011

Я новичок в MPI, и у меня возникли проблемы с реализацией mpirun на кластере узлов Mac OS X, работающих под управлением Snow Leopard. У меня проблема MPI_Barrier(). У меня есть простая функция, показанная ниже, которая отлично работает. Однако, когда я добавляю команду MPI_Barrier() в конце условия, родительский узел останавливается. Один из процессоров проходит мимо команды барьера, в то время как другой остается застрявшим. Я надеялся, что кто-нибудь может дать мне быстрый обходной путь или, возможно, предложить какой-то способ, которым моя сетевая среда не позволяет команде работать должным образом.

int main (int argc, char **argv)
{
    int me, np, q, sendto;
    double t0, t1;
    MPI_Status status;
    MPI_Init(&argc, &argv);
    t0 = MPI_Wtime();
    MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD,&np);
    MPI_Commm_rank(MPI_COMM_WORLD,&me);
    if (np%2 == 1) return 0;
    if (me%2 == 1) {sendto = me - 1;}
    else {sendto = me + 1;}
    if (me%2 == 0) {
        MPI_Send(&me, 1, MPI_INT, sendto, me, MPI_COMM_WORLD);
        MPIRecv(&q, 1, MPI_INT, sendto, sendto, MPI_COMM_WORLD, &status);
    } else {
        MPI_Recv(&q, 1, MPI_INT, sendto, sendto, MPI_COMM_WORLD,&status);
        MPI_Send(&me,1,MPI_INT,sendto,me,MPI_COMM_WORLD);
    }
    printf("Send %d to proc %d, received %d from proc %d\n",me,sendto,q,sendto);
    t1 = MPI_Wtime();
    printf("Timing is %g",t1-10);
    MPI_Finalize();
    return 0;
}

1 Ответ

0 голосов
/ 03 августа 2011

Кроме исправления нескольких опечаток, ваш код работает без проблем. Я использую openmpi и gnu c компилятор в кластере IBM. Я не уверен, где вы поставили барьер. Правильно ли я угадал?

#include "mpi.h"
#include "stdio.h"

int main (int argc, char **argv)
{
int me, np, q, sendto;
double t0, t1;
MPI_Status status;
MPI_Init(&argc, &argv);
t0 = MPI_Wtime();
MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD,&np);
MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD,&me);
if (np%2 == 1) {
  MPI_Finalize();
  return 0;
}
if (me%2 == 1) {sendto = me - 1;}
else {sendto = me + 1;}
if (me%2 == 0) {
  MPI_Send(&me, 1, MPI_INT, sendto, me, MPI_COMM_WORLD);
  MPI_Recv(&q, 1, MPI_INT, sendto, sendto, MPI_COMM_WORLD, &status);
} else {
  MPI_Recv(&q, 1, MPI_INT, sendto, sendto, MPI_COMM_WORLD,&status);
  MPI_Send(&me,1,MPI_INT,sendto,me,MPI_COMM_WORLD);
}
MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD);
printf("Send %d to proc %d, received %d from proc %d\n",
   me,sendto,q,sendto);
t1 = MPI_Wtime();
printf("Timing is %g\n",t1-t0);
MPI_Finalize();
return 0;
}
...