Вы можете установить корневой контекст вашего веб-сервиса со следующими аннотациями в вашем bean-компоненте ejb3: - @WebContext(contextRoot="/myservice", urlPattern="/myEndpoint")
Это должно сделать привязку веб-сервиса wsdl к http://jbossServer/myservice/myEndpoint?wsdl