Насколько я понимаю, правильный метод - использовать ndk-build и не вызывать компилятор напрямую.
В Android.mk вам нужно указать модуль для каждой статической библиотеки, которую вы хотите скомпилировать, изатем укажите, что ваша разделяемая библиотека должна его использовать.
Пример измененного файла Android.mk примера проекта hello-jni:
LOCAL_PATH := $(call my-dir)
# Define vars for library that will be build statically.
include $(CLEAR_VARS)
LOCAL_MODULE := <module_name>
LOCAL_C_INCLUDES := <header_files_path>
LOCAL_SRC_FILES := <list_of_src_files>
# Optional compiler flags.
LOCAL_LDLIBS = -lz -lm
LOCAL_CFLAGS = -Wall -pedantic -std=c99 -g
include $(BUILD_STATIC_LIBRARY)
# First lib, which will be built statically.
include $(CLEAR_VARS)
LOCAL_MODULE := hello-jni
LOCAL_STATIC_LIBRARIES := <module_name>
LOCAL_C_INCLUDES := <header_files_path>
LOCAL_SRC_FILES := hello-jni.c
include $(BUILD_SHARED_LIBRARY)
Если вы хотите контролировать, какие модули компилироватькогда вы запускаете ndk-build, вы можете создать файл Application.mk (в том же каталоге, что и Android.mk) и перечислить все модули, как в следующем примере:
APP_MODULES := <module_name_1> <module_name_2> ... <module_name_n>
Я думаю, что это поможет вам