Один дешевый и простой способ - настроить элемент управления веб-браузера и использовать его для входа в систему. Теперь у вас есть учетные данные для сайта.Затем нажмите кнопку, чтобы выключить URI для каждого из файлов XLS, открыв их в том же контексте, и затем сохранить на диске.
На самом деле вы можете скрыть элемент управления от пользователя.
Поскольку вы, похоже, управляете сайтом, я бы также рассмотрел возможность использования другой методологии для обслуживания этих битов, например службы WCF..