Логически (и вообще) все такие «метаданные» в базе данных обрабатываются структурно так же, как пользовательские данные; система просто поддерживает одну или несколько схем, предназначенных для данных системного уровня.
Физическая организация баз данных очень сильно зависит от поставщика, например база данных Oracle 10g организует данные на диске определенным образом. В этом случае вы с большей вероятностью получите конкретную обратную связь, если заметите, какой продукт базы данных вы используете.