Если вы говорите о страницах приложения, то лучший способ сделать это - просто добавить сопоставленную папку в каталог Layouts в проекте SharePoint, щелкнув правой кнопкой мыши проект и выбрав Add -> SharePoint Mapped Folder.
Создайте папку для вашего приложения в Layouts и добавьте aspx в эту папку. Ваш aspx будет автоматически развернут с вашим решением.