Используйте команду SQL COPY для записи в файловую систему сервера базы данных.
COPY tbl TO '/path/to/file/tbl.sql';
Существует множество опций для адаптации выходного формата.
Посмотрите мета-команду \copy psql, если вам нужно скопировать с удаленного сервера на локальный диск.