Немного погуглив, я нашел ответ. На самом деле правильная команда:
twiddle.bat --user="user" --password="pwd" get "jboss.management.local:name=jaas/foo/bar/MyBean,J2EEServer=Local,EJBModule=my_ejb.jar,J2EEApplication=my_ear.ear,j2eeType=StatelessSessionBean" stats
Необходимо также добавить jboss-management.jar в classpath, twiddle забыл это сделать.