Изменения БД будут проталкиваться в концептуальную модель, в большинстве случаев удаление столбца является особым случаем.Если в обновление модели включена эта функция, она может случайно удалить свойства, которые вы добавили в концептуальную модель независимо - это было бы плохо.
Чтобы удалить устаревший столбец, просто выделите его в конструкторе инажмите клавишу удаления.Вы также можете удалить столбец в файле EDMX, если вы можете обрабатывать редактирование CSDL.