Согласно Документации Google Appengine , ваш код может выглядеть следующим образом:
myNumber = 4
myResult = db.GqlQuery("SELECT * FROM myData WHERE filter = :num", num=myNumber)
или
myNumber = 4
myResult = db.GqlQuery("SELECT * FROM myData WHERE filter = :1", myNumber)
в зависимости от того, хотите ли вы использовать именованную или позиционную переменную.