Я понял, это не имело никакого отношения к этим параметрам.По умолчанию прямоугольник рисуется полностью перпендикулярно экрану, поэтому вы его не видите.Если вы хотите увидеть его с такими же размерами, как вы нарисовали, вы должны повернуть его по оси Y.Пример:
rect = new Rectangle(1, 1, 2, 2,new Color(255,0,0,255));
rect.rotation().y = 180;
rect.lightingEnabled(false);
scene.addChild(rect);
В случае, если это полезно для кого-то еще =)