Иерархическая кластеризация в R

Question

При использовании функции hclust я получаю следующую ошибку? Как я могу решить эту проблему? Я использую Windows 7 и версию 2.12.3 R.

n_seq <- 250                                                   
mat <- matrix(NA, ncol=n_seq, nrow=n_seq)    
for (idx in 1:n_seq) 
{mat[idx,idx] <- 0.0}         
for(idx in 1:(n_seq-1) )
{intemp <- read.xls("C:// clustal.xls", sheet = idx ); 
mat[(1+idx):n_seq,idx] <- intemp[1:(n_seq-idx), 11]}

fit <- hclust(as.dist(mat), method="single")

Error in hclust(as.dist(mat), method = "single") : 
NA/NaN/Inf in foreign function call (arg 11)

Пожалуйста, помогите мне решить эту проблему.

Answer 1

Это сообщение об ошибке возникает из-за того, что в матрице расстояний as.dist(mat) указано неверное значение (NA, NaN или Inf).Если вы посмотрите в коде hclust, 11-й аргумент вызова внешней функции (т.е. скомпилированным кодом) - это значения матрицы расстояний, и это то, на что жалуется R.По умолчанию NA, NaN или Inf не принимаются вызовами сторонних функций.См. ?.Fortran для получения дополнительной информации.