Не проверено, попробуйте изменить схему:
+ opts(strip.background = theme_rect(colour = 'purple'))
в конце вашего кода qplot / ggplot2. А если вы не знали: эта ссылка на ссылку Хэдли на github (не документацию) может помочь.
EDIT:
благодаря Джонатану я реализовал следующие работы, верхний фрагмент просто меняет контур. Это для заполнения:
+ opts(strip.background = theme_rect(fill = 'purple'))
Может быть, Хэдли это изменило?